la función set_magic_quotes_runtime() es descontinuada en PHP 5.3, para solucionar este problema debemos reemplazar la función  set_magic_quotes_runtime($valor) por ini_set("magic_quotes_runtime",$valor)

Pro ejemplo si este error lo tenemos en alguna librería ya existente lo podemos realizar en la línea de comando de linux:

sed -i "s/set_magic_quotes_runtime(/ini_set(\"magic_quotes_runtime\", /g" class.php